生物資源，特に絶滅危惧種の保護・管理には，実施単位とすべき遺伝的に独立

生物資源，特に絶滅危惧種の保護・管理には，
実施単位とすべき遺伝的に独立した個体群を識別
し，個体群の絶滅確率を左右する遺伝的多様性を
ミトコンドリア DNA 分析によるムツゴロウの
遺伝的集団構造
兼森雄一・竹垣 毅・夏苅 豊
〒852–8521 長崎市文教町1–14 長崎大学大学院生産科学研究科
（2006年1月19日受付；2006年4月14日改訂；2006年4月18日受理）
キーワード：有明海，遺存種，遺伝的多様性，絶滅危惧種，大陸，地理的隔離，ハゼ科，瓶首効果，八代海
Yuichi Kanemori, Takeshi Takegaki* and Yutaka Natsukari. 2006. Genetic population
structure of the mudskipper Boleophthalmus pectinirostris inferred from mitochondrial
DNA sequences. Japan. J. Ichthyol., 53(2): 133–141.
Abstract The genetic population structure of the mudskipper Boleophthalmus
pectinirostris was investigated based on nucleotide sequence data from the mitochondrial
control region (472 bp) of 131 individuals collected from four localities
in Ariake Bay, two in Yatsushiro Bay, Kyushu, Japan, one in Korea (Suncheon) and
one in China (Zhe Jiang). A total of 53 composite haplotypes were observed from
49 permutation sites. The estimated haplotype tree and pairwise Fst showed genetic
differentiation among the Suncheon, Zhe Jiang and Japanese populations.
The structures of the haplotype tree and network, and low genetic diversity of the
Japanese populations compared to that at Zhe Jiang suggested that a bottleneck effect
had occurred in the former after being isolated from the continental population
by rising sea levels (i.e., relictual species). Based on the number of unique haplotypes
in the Japanese populations and nucleotide substitution rate, the estimate of
the divergence time for the Japanese and Zhe Jiang populations was much greater
than that expected for the apparently relictual species distributed in Ariake Bay.
The Ariake and Yatsushiro populations formed a single group in the haplotype
tree, although the estimate of pairwise Fst showed a significant difference between
the populations, probably associated with the differences in frequency of the most
dominant haplotype. Accordingly, the two populations seemed to be genetically
differentiated from each other, probably due to the geographical isolation.
*Corresponding author: Graduate School of Science and Technology, Nagasaki
University, 1–14 Bunkyo-machi, Nagasaki 852–8521, Japan (e-mail: takegaki@
nagasaki-u.ac.jp)
魚類学雑誌 本論文・Full Paper 53(2): 133－141
Japanese Journal of
Ichthyology © The Ichthyological Society of Japan 2006把握しておく必要があるため（鷲谷・矢原，1996;
小池・松井，2003），対象となる個体群の内部や
個体群間の遺伝的変異の理解が不可欠である
(Feral, 2002; Ward, 2002)．ムツゴロウの遺伝的な
集団構造は過去にアロザイム分析によって検討さ
れ，韓国（木浦）と日本の有明海の個体群間には
遺伝的な差違があることが示唆されているが（佐
賀県有明水産振興センター，1993），国内の有明
海と八代海の海域間の遺伝的分化については検討
されていない

Kết quả (Việt) 1:

Bảo vệ và quản lý tài nguyên sinh học, đặc biệt là loài nguy cấp,Xác định một quần thể di truyền riêng biệt và thực hiện các đơn vị nênVà xác định khả năng tuyệt chủng của sự đa dạng di truyền dân,Boleophthalmus phân tích ADN ti thể sử dụng cácCấu trúc di truyền dânKanemori tỷ một, hàng rào, và giáo sư Yutaka852-8521 Nagasaki-shi bunkyo Cho 1-14 Nagasaki đại học trường đại học khoa học và công nghệ（ 1/2006 19, nhập học; 4/2006 14, sửa đổi: 4/2006 18, được chấp nhận ）Từ khóa: Biển Ariake, loài relict, đa dạng di truyền, nguy cơ tuyệt chủng loài, lục địa, địa lý cô lập, cá bống, có hiệu lực cổ chai, Yatsushiro biểnYuichi Kanemori, Takeshi Takegaki * và Yutaka Natsukari... 2006 dân di truyềncấu trúc của mudskipper Boleophthalmus pectinirostris suy ra từ ti thểTrình tự ADN. Nhật bản. J. Ichthyol., 53 (2): 133-141.Tóm tắt cấu trúc di truyền dân số của mudskipper Boleophthalmuspectinirostris được điều tra dựa trên dữ liệu trình tự nucleotide từ các ti thểkiểm soát vùng (472 bp) số 131 cá nhân được thu thập từ bốn địa phươngAriake Bay, hai tại Yatsushiro Bay, Kyushu, Nhật bản, và một tại Hàn Quốc (Suncheon)một Trung Quốc (Triết Giang). Tổng cộng 53 composite haplotypes đã được quan sát từ49 hoán vị các trang web. Ước tính khoảng haplotype cây và cử Fst cho thấy di truyềnsự khác biệt giữa các dân Suncheon, Triết Giang và Nhật bản.Các cấu trúc của haplotype cây và mạng và thấp sự đa dạng di truyền của cácDân số Nhật bản so với lúc Triết Giang Trạch dân đề nghị rằng một nút cổ chai hiệu ứngđã xảy ra năm trước đây sau khi bị cô lập từ dân số lục địado mực nước biển tăng (i. e., relictual loài). Dựa trên số lượng duy nhất haplotypestrong dân số Nhật bản và nucleotide thay thế tỷ lệ, các ước tính củathời gian phân kỳ cho dân Nhật bản và Triết Giang là lớn hơn nhiềuhơn mà dự kiến sẽ cho rõ ràng relictual loài phân bố ở Ariake Bay.Các quần thể Ariake và Yatsushiro hình thành một nhóm duy nhất trong haplotypecây, mặc dù các ước tính của cử Fst cho thấy một sự khác biệt đáng kể giữaCác quần thể, có lẽ liên quan đến sự khác biệt trong các tần số của hầu hết cáchaplotype chi phối. Theo đó, các quần thể hai dường như là di truyềnphân biệt với nhau, có lẽ do sự cô lập trong chủ đề Pháp.* Tương ứng tác giả: trường đại học khoa học và công nghệ, NagasakiTrường đại học, 1-14 Bunkyo-machi, Nagasaki 852-8521, Nhật bản (e-mail: takegaki @Nagasaki-u.AC.jp)Cá giấy khoa học tạp chí, đầy đủ giấy 53 (2): 133-141Tạp chí Nhật bảnNgư học © phải nắm The Ichthyological xã hội của Nhật bản 2006 （ washitani, yahara, 1996;Koike & Matsui, 2003 ）, hoặc bên trong của các quần thể mục tiêuCác biến thể di truyền giữa các dân của sự hiểu biết là không thể thiếu.(Feral, 2002; Ward, 2002). Mutsugoro, di truyềnCơ cấu dân trong quá khứ được coi là bằng cách phân tích allozymeVà trong giữa các dân số Ariake biển, Nhật bản và Hàn Quốc （ Mokpo ）Là một sự khác biệt di truyền cho thấy rằng （ MusaShiga tỉnh Ariake thủy sản, năm 1993 ）, Ariake Nhật bảnNghiên cứu di truyền sự khác biệt của vùng biển giữa biển và Yatsushiro biểnĐã không

Kết quả (Việt) 2:

Tài nguyên sinh vật, đặc biệt là trong việc bảo vệ và quản lý các loài nguy cấp,
để xác định độc lập dân di truyền cần được tiến hành đơn vị
để làm ảnh hưởng đến sự đa dạng di truyền xác suất tuyệt chủng của dân số
của Mutsugoro từ phân tích ADN ty thể
di truyền cơ cấu dân số
Kenmori Yuichi hàng rào tre Takeshi hè potash giàu
Yubinbango852-8521 Nagasaki cho giáo dục 1-14, Đại học Nagasaki Graduate School of Sciences sản xuất
(được chấp nhận 19 tháng 1 năm 2006; sửa đổi 14 tháng tư năm 2006; tháng 4 năm 2006 18 được chấp nhận)
Từ khóa: Sea Ariake, loài đang bị diệt vong, sự đa dạng di truyền, loài đang bị đe dọa, lục, cô lập về địa lý, Gobiidae, hiệu ứng nút cổ chai, Biển Yatsushiro
Yuichi Kanemori, Takeshi Takegaki * và Yutaka Natsukari 2006. dân di truyền.
cấu trúc của các Oxudercinae Boleophthalmus Pectinirostris suy ra từ mitochondrial
DNA .. Sequences Nhật Bản J. Ichthyol, 53 (2): 133-141 ..
Tóm tắt The Genetic cơ cấu dân số của Oxudercinae Boleophthalmus
Pectinirostris đã được điều tra dựa trên dữ liệu trình tự nucleotide của ti thể
khu vực kiểm soát (472 bp) của 131 cá nhân thu thập từ Bốn địa phương
trong Ariake Bay, hai trong Yatsushiro Bay, Kyushu, Nhật Bản, một ở Hàn Quốc (Suncheon) và
một tại Trung Quốc (Triết Giang). A Tổng số 53 haplotype hợp được quan sát từ
49 địa hoán vị. cây haplotype Ước tính và cặp FST Cho thấy di truyền
khác biệt Trong số các Suncheon, Triết Giang và quần Nhật Bản.
Các cấu trúc của cây haplotype và mạng, và đa dạng di truyền thấp của
quần Nhật Bản So với đó tại Triết Giang đề nghị đó một nút cổ chai hiệu
HAD xảy ra trong Cựu sau Bị cô lập từ dân Continental
do mực nước biển tăng cao (ví dụ, các loài Relictual). Dựa trên các số haplotype độc đáo
trong quần thể của Nhật Bản và tỷ lệ thay thế nucleotide, các Ước tính
thời gian khác nhau cho các quần thể của Nhật Bản và Jiang Zhe WS lớn hơn nhiều
so với dự kiến cho các loài đó Rõ ràng Relictual phân phối tại Ariake Bay.
Các Ariake và Yatsushiro quần Thành lập một nhóm duy nhất trong haplotype
cây, Mặc dù Ước tính của cặp FST Cho thấy một sự khác biệt đáng kể giữa
các quần thể, có thể là Kết hợp với sự khác biệt trong tần số của hầu hết
. haplotype trội Theo đó, hai quần Dường như để ĐƯỢC Genetically
biệt từ mỗi khác, có thể là Do sự cô lập địa lý.
* Tương ứng Author: Trường Đại Học Khoa học và Công nghệ, Nagasaki
Đại học, 1-14 Bunkyo-machi, Nagasaki 852-8521, Nhật Bản (e-mail: Takegaki @
Nagasaki-u.Ac.Jp)
tạp chí ngư học giấy-Full này Paper 53 (2): 133-141
Tạp chí Nhật Bản của
ngư học © The Ichthyological Xã hội Nhật Bản năm 2006 để hiểu kể từ khi nó là cần thiết để đặt (Washiya-Yahara, 1996;
Koike Matsui, 2003), và nội bộ của đối tượng dân số trở thành
là sự hiểu biết cần thiết của các biến dị di truyền giữa các quần thể
(Feral, 2002; Ward, 2002). Di truyền của Mutsugoro
cơ cấu dân số được coi là của quá khứ trong allozyme phân tích
được, South Korea (Mokpo) và giữa các dân biển Ariake của Nhật Bản
đã được gợi ý rằng có một sự khác biệt di truyền (tá dược
Higa Prefecture Ariake Thủy sản Trung tâm Xúc tiến, 1993), Ariake trong nước
nghiên cứu sự khác biệt di truyền giữa biển và các vùng nước biển Yatsushiro
đã không được